Roberto Mancini in Europa all'Inter non è mai riuscito a togliersi delle soddisfazioni al contrario di quanto fatto a livello nazionale. Contro il Villareal arriva la prima delusione in Champions League per il 'Mancio', erano i quarti di finale, dopo aver vinto per 2-1 in casa a San Siro, gli spagnoli ribaltarono il risultato al 'Madrigal' vincendo per 2-0. Nella seconda esperienza in Champions, altra eliminazione da parte di una spagnola, questa volta è il Valencia che mette fine ai sogni di gloria nerazzurri. 2-2 all'andata sempre a Milano, al ritorno partita da dimenticare ricordata soprattutto per la rissa che coinvolse Burdisso.